Manuscrits de la bibliothèque des abbés de Tournus, dont les manuscrit du moine Ermentaire décrivant la translation des reliques de saint Philibert depuis Noirmoutiers (X^e s.), du moine Falcon, dit Chronicon Trenorchiense (XI^e s.), et celui du moine Garnier consacré à la mémoire de saint Valérien (XII^e s.)
 

Fonds des XVII^e, XVIII^e et XIX^e siècles : droit, sciences, religion, histoire, voyages et découvertes, métiers et techniques

Fonds local :
* personnalités : Jean-Louis Bompar, historien (XIX^e s.), Pierre-François Chifflet, religieux jésuite, historien (1592-1682), Henri Curé, chanoine et historien (XIX^e-XX^e s.), cardinal de Fleury, cardinal, abbé de Saint-Philibert de Tournus et ministre de Louis XV (1653-1743), Pierre Juénin, historien et chanoine de Saint-Philibert de Tournus (1668-1747), Jean Machoud, historien de Tournus (mort en 1669), Jean Magnon, auteur dramatique et poète (1620-1662), Jean Martin, bibliothécaire, créateur du musée Greuze et de la Société des amis des arts et des sciences de Tournus (1839-1920), Émile Meulien, historien (XIX^e s.), Pierre de Saint-Julien de Balleure, historien et chanoine (1520-1593), Albert Thibaudet, écrivain et critique littéraire (1874-1936)
* bulletins et ouvrages édités par la Société des amis des arts et des sciences de Tournus, études des érudits locaux (Albert Bernard, Henri Curé, Charles Dard, Gabriel Jeanton, Jean Martin, Émile Meulien, etc.)
* aire géographique : Tournus, Saône-et-Loire, Bourgogne